Rektor prof. dr hab. Andrzej Tretyn powołał dyrektorów pięciu szkół doktorskich działających na Uniwersytecie Mikołaja Kopernika w Toruniu.
Interdyscyplinarne szkoły doktorskie są elementem systemu kształcenia doktorantów wprowadzonego w 2019 r. przez reformę nauki i szkolnictwa wyższego. Zastąpiły one wcześniejsze studia doktoranckie (III stopnia) prowadzone na poszczególnych wydziałach.
Na UMK działa pięć szkół doktorskich.
Dyrektorem Interdyscyplinarnej Szkoły Doktorskiej "Academia Copernicana" została prof. dr hab. Iwona Łakomska z Wydziału Chemii. Szkołą Doktorską Nauk Humanistycznych, Teologicznych i Artystycznych pokieruje prof. dr hab. Anna Branach-Kallas z Wydziału Humanistycznego, a Szkołą Doktorską Nauk Medycznych i Nauk o Zdrowiu – prof. dr hab. Marta Pokrywczyńska z Wydziału Lekarskiego Collegium Medicum UMK.
Dyrektorem Interdyscyplinarnej Szkoły Doktorskiej Nauk Społecznych pozostaje prof. dr hab. Tomasz Szlendak z Wydziału Filozofii i Nauk Społecznych, a Szkoły Doktorskiej Nauk Ścisłych i Przyrodniczych prof. dr hab. Wiesław Nowak z Wydziału Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej.